zotero,知识管理软件,文献管理,论文写作,业务素质

快乐的鱼儿 2016-12-02 09:49:42

文献管理软件zotero的一点使用感受 | 大家都叫我老杨

作者是我的本科同学 @yjx04,现在在美国念博士

文章写于去年12月,我做了一些排版上的修改,括号内的蓝字为我所加


zotero简介


zotero(zotero.org)是Firefox浏览器下的一款扩展(add-on),虽然它的桌面版已经在开发中了,但短时间内只能通过打开浏览器来使用,好在对于现代人来说,使用电脑的大多数时间都在对着浏览器。(现在zotero standalone版本已经开发到beta版,支持safari和chrome)

在 我看来,zotero的主要使用者应该还是科研人员,尤其是广大还在研究生院里挣扎的学生。作为一款浏览器扩展,简单的说,zotero就像是把 Endnote这种专业的文献管理软件的核心功能整合到firefox浏览器中,通过在浏览器里简单的点击鼠标来收集论文,图书的信息(像是作者,期刊名 等等等等)。通过在word里安装zotero的相关插件,可以在论文里方便的插入参考书目。作为一款免费扩展,zotero极其便捷的科学文献信息采集 /输出功能应该是它对我们最大的吸引力。

其实,除了文献管理,zotero还有很多其他功能,它可用来当做网摘工具,可以直接存储本地文件,可以作为云存储方案,还可以通过创建Group Librery来共享文献。但这些都不像是zotero的核心功能。

科学文献管理

强大的抓取功能


zotero 最引人注目的就是它便捷的文献引用信息(citation information)抓取功能,当你使用firefox打开任何论文,图书的网页时,zotero都可以自动感知citation information,并会在浏览器地址栏的右侧出现对应的小图标,只要点击一下,zotero就自动抓取该篇论文的所有引用信息存储于本地数据库中, 所抓取的信息还自动附有原始的url,便于以后回来再次查看。

在论文页面:

(zotero最新版本在你保存引用信息的时候会尝试下载原文)

还可以采集书籍(我一般都是抓google book):

 

如果网页上有多个文献(例如通过google scholar搜索到的页面),zotero会给出一个文件夹图标,点击它会跳出对话框,由你选择需要抓取的项目:

zotero的这种自动感知功能十分强大,journal的网页我目前还没有碰到过不能感知的。实际上自动感知所支持的网页还有Amazon,Nytimes(应该是给商科用的吧)等等,而且zotero支持的网页数目还在持续增长。

我没有用过endnote等其他的工具,但通过点击一下小图标就能完成抓取,应该算是够方便了吧。

(zotero 有代理功能,比如你访问sciencedirect是通过学校图书馆的代理,此时zotero会提示你要不要记住这个代理,如果选择记住以后不管从哪里访 问sciencedirect,zotero都会把页面重定向到那个代理,这样用google scholar搜索然后再找全文就比较方便)

便捷的笔记功能


做科研当然不能只是存储大量的文献,zotero也提供了很好用的笔记功能,你可以建立stand alone类型的笔记:

或者是作为一篇文献的子文件(这也是我最常用的):

Zotero还提供了tags(通过标签来对文献分类),related to(在文献之间建立超链接)来进一步管理文献。感兴趣的同学可以自己查看。

我自己在zotero里组织文献的方式使用的是最土的文件夹方式:

每一个子文件夹内都是某个小项目的的文献,点击父文件夹Research可以看到所有的条目,然后可以通过zotero强大的搜索快速定位自己感兴趣的条目(像是某一位作者的论文)。这个下面还要提到.

输出功能


Zotero可以由你选取若干条目来生成Bibliography(文献目录):

这个是点击后选择rtf格式输出的效果:

与其他软件的整合(wordlatex等)


除了直接生成Bibliography, zotero还提供了与多种软件的整合,例如MS word, 官网的一段视频最好的说明了这个功能。

简单的说,在安装了这个Word Plugin之后,你的word工具栏上会多出几个按钮,通过点击它们,你可以在文档的任何地方插入引文,在文章末尾生成Bibliography。而且你可以随时改变引文的格式,以适应不同的要求。对于要写论文的人,应该是很省力的。

为了推广zotero,开发者推出了一系列与其他软件整合的工具,像是latex,word等,甚至还有wordpress,点击这里可以看到所有的plugin。

如果你是从Endnote转来的用户,zotero也可以导入endnote里文献信息,可以看这篇博文

Metadata retrieve功能


如果手头只有pdf版的论文,想要获取引用信息,怎么办?zotero提供了很好用的自动通过网络抓取引用信息的功能(Retrieve Metadata for PDF):

这个是原始文档:

(实际上可以把自己的文献库同步到zotero的服务器上,并且好像可以和其他研究者合作,具体请查看官网)

其他功能

网摘


除了对科学文献进行管理,zotero的抓取功能对一般的网页也有效,它可以保存当前的网页快照,结合firefox的其他有趣的插件,可以有很好的效果,完全可以胜任一个优秀的网摘的软件:

这是原始网页:

这是经过Readability插件处理过,由zotero抓取的网页快照,你甚至可以在上面添加自己的note,以及高亮文本:

效果还是不错的,在zotero面板里可以看到该条目:

本地文件管理


除了通过浏览器添加内容,zotero也支持添加本地文件,你可以将电脑上的电子书,照片,甚至是视频添加进来,进行管理。(只要把文件拖拽进zotero就行,也可以把文件从zotero里面拖拽出来)

下面这个就是我这个学期数学课的所有相关文件:

(我的建议是使用PDF xchange viewer在firefox里面内嵌查看PDF,还可以加批注。不需要批注的话PDF阅览器推荐Sumatra PDF,快得发指)

善用检索功能


zotero有很好的全文检索功能,这里的全文检索是真正的连pdf文件内部都能搜索到(win下需要安装pdfinfo及pdftotext两个小软件,在preferences-search里),下面是个例子,搜索所有与关键词相关的项目:

(zotero还有保存搜索的功能,类似iTunes里面的智能播放列表)

可以看到,pdf的文件名,用户添加的note,pdf内部都能被搜索到。

对于研究生,难免要读很多论文,对每一篇论文,都顺手写上自己的认识,zotero自动帮你把笔记与pdf文件收纳于一个项目里,这样以后也便于查找,能做到这样,可能是做好文献管理的第一步吧。

待改善的地方


Zotero有一些小问题,譬如当你存储的文件越来越多,在firefox里打开zotero就变得越慢,这可能短时间没办法解决,只能期待桌面版了。

(对中国期刊网,中国知网目前支持不好,只有通过下载引文信息来添加)

相关站点和博文


  • 我的同学老杨写了好几篇应用zotero的博文,他的其他博文也很值得推荐。

  • 研究生2.0, 一个台湾的博客,也有写一些zotero的文章(这里

  • 最好的当然还是官网


后记-道与术的迷思


很久以前因为老杨的影响开始接触zotero,几乎也是同一时候开始接触firefox浏览器,vim等等。总之开始折腾各种软件,一直到现在这股热情也还没有完全消退。

软 件对于现代人也许只能相当于“术”吧,“道”和“术”其实都可以对一个人的工作效率产生影响,就像GTD(Getting Things Done)方法,简单了解一下就知道就像一种思维的“软件”, 网上很多人热衷讨论各种GTD工具,GTD的方法里有任务清单的概念,可事实上呢,连我爸 爸都知道每天到办公室,要把一天要做的事列在桌上的台历上以免忘记,可见GTD并不是多高级的行事方法。那么究竟什么是“道”呢?

坦白的说,我没有答案。

也 许,一个人真正的知识才是他最厉害的“道”吧,数学底子好的人,即便没学过会计,也能很快学会看懂财务报表;编程底子好的人,即便没有接触过 matlab,也肯定能很快学会写m-file;中文功底好的人,从零学英语,最后写出来的英文也要比普通人更有文采;一个雷历风行,从不拖拉的人,即便 没接触过GTD,也一定能很快完成工作。

这种“道”,不是看一两篇文章就能学来的,而真的要靠时间的累积。